基础实验:做科研必须收藏的36个实用生物数据库
1、miRNA靶基因预测数据库 TargetScan：预测miRNA靶基因的常用数据库。 PITA：提供miRNA与靶基因结合位点的预测服务。 miRBase：存储miRNA序列信息的权威数据库。 microRA.org：预测miRNA靶标和功能的数据库。 miRTarBase：实验验证的miRNA靶标数据库。
2、做科研时，以下是一些必须收藏的实用生物数据库：中国生物志库： 权威全面：这是中国首个具有完整知识产权的权威生物物种全信息数据库，收录了中国10万余种现生生物物种，数据覆盖植物、动物、藻类、菌物、海洋生物等多个领域。
3、科研中常用的生物医学数据库涵盖基因、蛋白、非编码RNA、RNA修饰及测序分析等多个领域，具体如下：基因查询 NCBI-Gene：由美国国家生物技术信息中心（NCBI）提供，整合基因序列、功能注释、参考文献及关联疾病信息，支持通过基因名、物种或序列进行检索，是基因研究的基础工具。
4、科研常用生物医学数据库主要包括以下几类： 基因查询数据库： NCBIgene：提供全面的基因信息，是基因研究的重要工具。 GeneCards：包含详细的基因注释和功能信息，有助于理解基因在生物体中的作用。 UCSC Genome Browser：提供基因组序列的浏览、分析和可视化功能，支持多种基因查询需求。
...HSD1的mRNA序列,怎么设计siRNA来做RNA干扰沉默该基因呢?
点击你要的序列号，会进入这个基因的基本信息，一直往下拉会看到mRNA and Protein(s) ，NM开头的序列号就是其CDNA的序列了。
长度：siRNA序列不宜过长，超过30nt易导致其与其他mRNA非特异性结合，一般以19-25nt之间为宜。GC含量：控制在35-55%之间，基因沉默效果最好。靶序列：siRNA序列设计的靶序列一般为目的基因的CDS序列。序列数量：一般siRNA需设计2-4条，另需要对照1-2条。
怎么在NCBI上查到11-βHSD1的mRNA序列，怎么设计siRNA来做RNA干扰沉默该基因呢？很基础的问题啊，在NCBI上search：gene，下面的对话框输入你要找的基因的名称，会出来相关的基因序列，看你要找什么物种的，一般是人和鼠的，如人的后缀是Homosapiens，鼠的是Mu**usculus。
siRNA（**all interfering RNA）是一种小RNA分子，能够与靶向特异性的mRNA结合，通过RNA介导的沉默复合体RISC（RNA-induce siliencing complex）介导mRNA的降解，从而导致转录后基因沉默。设计高效的siRNA序列需要遵循一定的原则，并经过严密的设计和实验验证。
siRNA设计软件/网站汇总(最全最详细,所有网站列表)
1、上海吉荧生物本地siRNA设计软件特点：上千个基因验证，有效率95%以上。用途：适用于需要高可靠性和实验验证支持的siRNA设计。设计建议 交叉验证：强烈建议使用至少两个不同的工具来设计siRNA，选择那些在两个工具中都获得高评分/推荐的序列，以提高成功率。
2、基因沉默实验siRNA设计和转染详解汇总siRNA设计 小干扰RNA（**all interfering RNA；siRNA）是一段长度在20-25个核苷酸之间的RNA双链，主要用于干扰RNA，达到调节基因表达（敲减）的目的。其本质是siRNA和相应的mRNA特异性结合、降解，继而实现阻滞mRNA继续翻译的目的。
3、手把手教学｜基因沉默实验：siRNA设计和转染siRNA设计小干扰RNA（**all interfering RNA；siRNA）是一段长度在20-25个核苷酸之间的RNA双链，主要用于干扰RNA，达到调节基因表达（敲减）的目的。其本质是siRNA和相应的mRNA特异性结合、降解，继而实现阻滞mRNA继续翻译的目的。